Чукотский территориальный фонд обязательного медицинского страхования образован 30 июля 1993 года решением № 133 Малого Совета народных депутатов Чукотского автономного округа.
Положение о Чукотском территориальном фонде ОМС утверждено Постановлением Думы Чукотского автономного округа 06 июня 2000 г. № 119. 
На основании Распоряжения Правительства Чукотского автономного округа от 27 декабря 2011 г. № 640-рп директором Чукотского территориального фонда обязательного медицинского страхования назначен Чагин Андрей Петрович.

Численность исполнительной дирекции фонда ОМС по состоянию на 01.03.2008 г. составляет 26 человек.